蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定

單一蛋白質(zhì)或者蛋白混合物的蛋白質(zhì)譜鑒定/分析，以及對(duì)單一蛋白質(zhì)的蛋白序列分析是生物學(xué)研究中經(jīng)常遇到的問題。基于質(zhì)譜法獲取蛋白質(zhì)序列的序列信息以及通過質(zhì)譜法進(jìn)行蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定，蛋白質(zhì)譜分析從而實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)鑒定，既protein identification，基于LC-MS的蛋白質(zhì)譜鑒定。常見分析包括：質(zhì)譜測(cè)定蛋白分子量，蛋白的N端和C端測(cè)序，蛋白質(zhì)序列分析及，翻譯后修飾位點(diǎn)分析等。

百泰派克公司采用超高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，基于Thermo Fisher公司的Q Exactive質(zhì)譜儀、LTQ Orbitrap Elite質(zhì)譜儀、Orbitrap Fusion? Lumos? Tribrid? 質(zhì)譜儀，結(jié)合 Nano-LC液相色譜技術(shù)，能夠?qū)Φ鞍踪|(zhì)提取物、SDS-PAGE蛋白條帶、2D蛋白膠點(diǎn)、pull-down及co-IP等樣品中的蛋白質(zhì)進(jìn)行高效**的蛋白質(zhì)譜鑒定服務(wù)。

百泰派克可提供以下蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定服務(wù)：

1，對(duì)純化蛋白進(jìn)行蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析/質(zhì)譜鑒定；
2，對(duì)蛋白膠點(diǎn)，蛋白質(zhì)膠條質(zhì)譜鑒定，蛋白銀染膠質(zhì)譜鑒定，考染/熒光/Zn/Cu2+等類型染色的膠點(diǎn)/膠條樣品進(jìn)行鑒定；可參見：蛋白膠點(diǎn)、膠條、IP樣品蛋白質(zhì)鑒定服務(wù)
3，對(duì)pull-down蛋白質(zhì)譜鑒定、IP蛋白互作的IP-MS互作蛋白鑒定、co-IP質(zhì)譜驗(yàn)證互作蛋白，免疫共沉淀結(jié)合質(zhì)譜驗(yàn)證，等簡(jiǎn)單混合物樣品中的蛋白樣品進(jìn)行蛋白質(zhì)鑒定/分析。
4，對(duì)復(fù)雜樣品中的未知蛋白質(zhì)進(jìn)行蛋白質(zhì)譜分析/蛋白質(zhì)譜鑒定。即使是非常低濃度的蛋白樣品也可能通過蛋白質(zhì)譜鑒定

對(duì)于單一蛋白質(zhì)和簡(jiǎn)單蛋白混合物的鑒定，我們保證100%的鑒定率，否則不收任何費(fèi)用。

NanoLC-MS/MS分析簡(jiǎn)單或復(fù)雜混合物中的蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析。樣品可以是來自于SDS-PAGE凝膠中的條帶或蛋白點(diǎn)，也可以是溶液樣品。（我司也提供1D 或2D SDS-PAGE服務(wù)，點(diǎn)擊了解詳情。）

百泰派克基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定流程:

樣品前處理
首先，用二硫蘇糖醇（DTT）還原蛋白質(zhì)樣品，用碘乙酰胺（IAA）烷基化。然后用胰蛋白酶對(duì)樣品進(jìn)行消化，一般樣品會(huì)在賴氨酸和精氨酸殘基后發(fā)生斷裂。最后，凍干得到多肽片段。

上機(jī)分析
將樣品用NanoLC的A相重新溶解后上樣，在NanoLC-MS/MS系統(tǒng)下分析。

數(shù)據(jù)庫(kù)檢索
根據(jù)樣品物種來源從UniProt**對(duì)應(yīng)物種的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)，使用MaxQuant、Proteome Discoverer、Peaks等**將液質(zhì)聯(lián)用得到的數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫(kù)中數(shù)據(jù)進(jìn)行匹配，通過肽段的一級(jí)和二級(jí)碎片的質(zhì)量在數(shù)據(jù)庫(kù)中找到匹配的蛋白質(zhì)，從而鑒定樣品中的蛋白質(zhì)。

如果樣品的物種還沒有完整的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)，我們將使用親緣較近物種的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)或者是同種模式生物的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行蛋白鑒定分析。

出具報(bào)告
鑒定報(bào)告中會(huì)包括詳細(xì)的樣品前處理步驟，色譜-質(zhì)譜平臺(tái)參數(shù)，以及鑒定得到的蛋白質(zhì)列表和肽段列表。質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)會(huì)通過網(wǎng)盤形式提供。

您只需把您的樣品收集后提供給我們，后續(xù)所有步驟均由我們完成。百泰派克公司基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定/質(zhì)譜分析服務(wù)包括：樣品前處理-蛋白還原烷基化后使用高度特異性的蛋白酶進(jìn)行蛋白樣品消化，獲得多肽片段；上機(jī)分析-通過納升級(jí)色譜（nano-flow）結(jié)合高分辨率質(zhì)譜，在**的靈敏度下對(duì)肽段進(jìn)行分離并使用超高分辨率質(zhì)譜儀采集肽段質(zhì)譜數(shù)據(jù)；數(shù)據(jù)庫(kù)檢索-結(jié)合樣品物種對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)成千上萬張質(zhì)譜圖進(jìn)行分析（使用Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)，每月更新一次數(shù)據(jù)庫(kù)，以確保訪問最新數(shù)據(jù)），從而實(shí)現(xiàn)樣品中蛋白的蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定；到最后出具樣品報(bào)告，均由百泰派克公司一站式完成：

1. 客戶提供了包含一種或多種蛋白質(zhì)的樣品，如膠條，膠帶，溶液或固體樣品，pull-down或co-IP樣品。
2. 百泰派克公司根據(jù)樣品情況，選擇合適的酶，對(duì)來樣進(jìn)行蛋白酶消化，然后進(jìn)行nanoLC-MS / MS分析。
3. 對(duì)獲取的數(shù)據(jù)進(jìn)行搜庫(kù)分析。
4. 在10-15個(gè)工作日內(nèi)收到報(bào)告。

*如果您的樣品中含有洗滌劑/裂解劑，請(qǐng)?jiān)谒蜆訂沃凶⒚鳌?/p>