蛋白膠點、膠條、IP樣品蛋白質鑒定

百泰派克生物結合MALDI-TOF質譜系統與LC-MS/MS質譜系統，提供**準確的蛋白膠點、膠條、IP樣品，CO-IP樣品蛋白鑒定服務。可鑒定的樣品包括：1D-SDS PAGE分離的蛋白膠條，2DE PAGE中的蛋白膠點，蛋白表達產物，免疫共沉淀（Co-IP）樣品。其中，蛋白質樣品的鑒定前處理過程嚴格按照Nature Methods發表的文章：Universal sample preparation method for proteome analysis進行，保證鑒定試驗中得到更高的肽段覆蓋率。質譜鑒定的原理則是基于鳥**法（Shot-gun）：將蛋白條帶或者蛋白溶液酶切成肽段混合物，經高效液相色譜分離得到若干較為簡單的組分，進入高分辨率質譜儀中進行分析。檢索**根據二級質譜信息與相應的數據庫比對，結合匹配度打分及錯配過濾，可得到肽段的確切序列，進而拼接出各蛋白的完整序列，從而實現對蛋白的鑒定。

蛋白質質譜鑒定流程

基于鳥**法（shot-gun）LC-MS的蛋白鑒定流程

關于樣品

1D SDS PAGE /2D PAGE gels樣品：
1. Coomassie Blue, SYPRO Ruby 以及Silver stain樣品均可進行蛋白的鑒定試驗；
2. 銀染的樣品有可能與后續的質譜分析不兼容，我們推薦您使用下面的產品或者實驗步驟進行銀染實驗：
ProteoSilver Plus, Sigma (Product # PROTSIL1 or PROTSIL2)
Dodeca Silver Stain, BioRad (Product # 161-0481 or 161-0480)
3. 銀染的樣品請不要進行脫色處理

液體樣品（In solution format）：
1. 假如樣品中蛋白量＞10ug，我們對樣品的緩沖體系沒有要求；
2. 假如樣品中蛋白量＜10ug，樣品準備過程中盡量減少SDS等表面活性劑的使用，并注意降低鹽濃度；
3. 提交樣品過程中，注意提供樣品的緩沖體系和樣品中蛋白的預估含量；

Co-IP樣品：
1. 如果您洗脫的樣品需要跑膠，請按照1D SDS PAGE樣品準備要求準備樣品即可；
2. 如果您直接提交洗脫樣品，我們推薦使用HPH EB (0.5 M NH4OH, 0.5 mM EDTA) 緩沖體系進行蛋白洗脫，保證洗脫緩沖體系與后續的質譜實驗兼容；

樣品運輸：
1. 我們推薦您將樣品凍干后進行運輸，凍干樣品中蛋白非常**。
2. 液體樣品推薦干冰運輸，短途運輸冰袋也可以。

注意事項： 利用質譜進行蛋白樣品的鑒定，在樣品準備過程中需佩戴手套和頭套，盡量避免自身角蛋白（keratin）對樣品的污染。

研究案例

該項目是中國科學院生物物理所一位老師將她的Co-IP的樣品寄給我們進行蛋白鑒定。得到的部分結果如下圖所示：

蛋白質膠點鑒定、膠條、IP樣品蛋白鑒定研究案例

從圖中客戶看出，我們提供的結果報告中包含鑒定到的蛋白的Accession Number, Peptide coverage, 鑒定出的肽段信息，鑒定出的肽段的修飾信息以及對鑒定到的蛋白的詳細描述。

中/英文項目報告：

在技術報告中，百泰派克會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告，報告包括：

1. 實驗步驟（中英文）
2. 相關的質譜參數（中英文）
3. 質譜圖片
4. 原始數據
5. 鑒定的蛋白質詳細信息

蛋白膠點、膠條、IP樣品質譜鑒定一站式服務

您只需下單-寄送樣品
百泰派克一站式服務完成：樣品處理-上機分析-數據分析-項目報告